水虫の再検査

初めて質問させていただきます。
足裏の皮めくれがあり、４月末に皮膚科で顕微鏡で検査してもらい
はくせん菌がいたため、塗り薬を塗っているのですが
５ヶ月経っても皮はめくれたまま良くなりません。
菌がいるか再検査していただきたいのですが、薬を塗ってると
菌がいてもでてこないと言われました。
薬を塗らない期間をどれくらい設ければ、菌がいた場合
検査で菌を見付ける事が出来るのでしょうか？
よろしくお願い致します。